适用于:获取细胞转染级的质粒
提取前一天,15 mL培养基接菌。至提取时,摇菌12 h~16 h。
5000 rpm离心5 min,弃去上清液。5000 rpm离心1 min,用枪吸弃上清液。
500 uL S1重悬菌体沉淀,转移至2 mL管。37℃静置10 min。
500 uL S2裂解菌体,颠倒7次。
打冰。每管再加入250 uL N3,颠倒混匀51次。最高转速5 min。
准备新的1.5 mL,每管加入125 uL ETR。
将5中的离心后上清倒入6中的1.5 mL管中,混匀,插入冰上,静置10 min,期间多次颠倒,溶液变无色透明。
提前打开42℃金属浴,在10 min后将1.5 mL管置于42℃,孵育5 min,可见溶液变浑浊。
准备新的2 mL管,每管加入625 uL乙醇(0.5倍液体体积)。
12000 g 3 min离心,用枪吸取上清转移至9的2 mL管。颠倒混匀。
准备吸附柱,每根柱加250 uL 3M NaOH,12000 g 离心1 min。弃去滤液。
将10中2 mL管液体按每次700 uL转移至吸附柱,12000 g 离心10 s,弃去滤液,直到2 mL管中液体转移完。
将500 uL HBC 加入吸附柱,12000g 离心1 min,弃去滤液。
将700 uL washing buffer加入吸附柱,12000g 离心10s,弃去滤液。
重复14。
12000g 空离 2min。
准备新的1.5 mL管,将空离后的柱子转移到1.5 mL管,开盖静置5 min。
提前预热EB于55℃。每根柱子加60 uL EB,静置1 min,最大转速离心 30 s。
将1.5 mL管中液体再次加入吸附柱,最大转速离心 30 s。
测浓度。
PS:
步骤4,孵育时间不超过5 min,混匀时轻柔,以免破坏基因组。
步骤7溶液不透明,可能是步骤5颠倒次数不足,或者离心速度(时间)不足。
如果最后浓度很低(260/230位于1.8~2.0),但是初始菌体很多,可能是①抗生素失效;②3M NaOH不新鲜;③EB没预热;④HBC或者washing buffer未加异丙醇或无水乙醇。